Anestezili MR, uygulamanın özelliklerine bağlı olarak hastanın uykusunda veya sedasyon adı verilen hafif bir uyku halinde olması gerektiği için yapılan bir MR türüdür. Bu tür MR çekimleri, genellikle çocuklarda, yoğun anksiyetesi olan hastalarda veya hareket kontrolü mümkün olmayan hastalarda yapılır. Anestezili MR, hastanın rahatlığı için önemli bir seçenek olabilir, ancak sedasyon kullanımı gibi bazı riskleri de beraberinde getirir.